Research Thematics
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Appel à candidature pour la future direction du GReD
Le GReD lance un appel à candidature pour recruter sa future directrice ou futur directeur, pour une prise de fonction en janvier 2021
La recherche contre le cancer au GReD : De la paillasse… à la Courstache !
L’équipe NuReP mise en lumière dans un article de La Montagne de l’édition du Vendredi 2 Novembre dans le cadre du mois « MOVEMBER » de soutien aux patients atteints de cancers masculins (testicules et prostate).
Toujours dans le cadre de "MOVEMBER" les membres de l’équipe NuReP ont également participé à la course caritative « La Courstache » édition #2 qui a eu lieu à Aubière le samedi 3 Novembre.
sRNAPipe: a Galaxy-based pipeline for bioinformatic in-depth exploration of small RNAseq data
Les recherches menées au cours de cette dernière décennie ont révélé que la quasi-totalité des génomes est transcrite et que la plupart des molécules d’ARN ainsi produites correspondent à de multiples classes de petits ARN non codants. Malgré l'importance de ces découvertes, aucun outil bioinformatique, simple d’utilisation, n’a été développé à ce jour pour analyser des données de séquençage ciblant ces petits ARNs ("small RNA-Seq"). Dans cette étude, publiée dans mobile DNA (Pogorelcnik et al., 2018), l'équipe de C. Vaury et E. Brasset présente précisément un nouveau pipeline qui permet une analyse rapide de données de small RNA-Seq. Pour faciliter son utilisation par les biologistes, le pipeline a été intégré avec une interface conviviale à un portail Galaxy.
Les Mardis du GRed - Novembre 2018
12H45 – 13H45
Faculté de médecine
Amphi limagne (CRBC RdC)
Les donateurs AFM-Téléthon à la rencontre des équipes de recherche du GReD
Le 8 octobre dernier le GReD organisait une journée Portes ouvertes aux donateurs de l’Association Française contre les Myopathies (AFM-Téléthon).
A key developmental stage for the targeting of transposable elements by piRNAs.
In few germline cells located at the anterior pole of the Drosophila ovariole, Piwi expression is weakened. This short time of germline development has been called the Piwiless pocket or Pilp (Dufourt et al. 2014).
In its last sudy, pubilshed in NAR (Théron et al., ) , the C. Vaury and E. Brasset team evidenced that Pilp is a key developmental stage for amplifying and specifying the piRNA repertoire targeting transposable elements.
TRAINING SCHOOL 3D-FisH & IMAGE ANALYSIS
October 15-19th, 2018
The Probst-Tatout’team organizes a training school in "3D-FiSH and Image Analysis" in the frame of INDEPTH. This first training school will also be supported at the local scale by the University Clermont Auvergne), the Wide Open to the World (WOW!) Program from the CAP20-25 project and by the GReD laboratory through its Confocal Imaging Platform.
GH1-HMGA1 : une protéine chromatinienne impliquée dans la stabilité des télomères et la réparation des cassures double brin de l’ADN
De par leur nature linéaire, les chromosomes des eucaryotes ont dû développer des mécanismes de protection de leurs extrémités appelés télomères. Si ces mécanismes sont défaillant, les télomères sont reconnus par la cellule comme des cassures de l’ADN et vont donc être « réparés » de façon abusive et engendrer des dommages génomiques dramatiques pour la cellule. Chez l’homme, l’ADN télomérique est remodelé par un complexe protéique spécifique, qui constituent une « coiffe » qui a pour rôle principal d’assurer la protection du génome. Malgré d’intenses recherches, très peu de protéines impliquées dans l'homéostasie des télomères ont été identifiées chez les plantes.
Dans sa dernière étude (Charbonnel et al.), le groupe de Charles White décrit le rôle de la protéine GH1-HMGA1 dans l’homéostasie télomérique ainsi que dans la réparation de l’ADN chez la plante Arabidopsis thaliana.
How to turn a football into a rugby ball?
Tissue elongation is part of the repertoire of processes that allow an organ to acquire its shape (morphogenesis). In the last years, the elongation of the ovarian follicle of Drosophila has emerged as a model of choice for the study of tissue elongation mechanisms. During its development the initially spherical follicle becomes ovoid and this elongation is controlled by the epithelial cells surrounding each follicle. However, so far, all studies on the subject have focused on the basal domain of these cells.
In its last study (Alegot et al.,) , the group of Vincent Mirouse has shown that the apical domain of the epithelial cells also contributed to this elongation.
DNA methylation : a new actor in CML biology
Chronic myeloid leukemia (CML), a cancer of the white blood cell, results from a translocation event that ultimately leads to the production of BCR-ABL1, a chimeric oncoprotein that promotes CML by aberrantly phosphorylating target proteins. Nonetheless, this event on its own, cannot account for an increasing number of clinical observation suggesting the involvement of other pathways, among which DNA methylation alteration emerges as a relevant candidate.
On that basis the teams of Marc BERGER (CHU, Clermont-Ferrand) and Philippe ARNAUD have characterized for the first time the DNA methylation patterns of CML cell subsets (immature and mature cells) isolated form the same clone during the early stage of the disease, before any treatment (Maupetit-Méhouas, Court, Bourgne et al.,). Altogether, this collaborative study demonstrated that DNA methylation abnormalities exist at early stages of CML and can affect the transcriptional landscape of malignant cells. These observations paved the way for new therapeutic strategies based on epigenetic drugs.
In a few words...
The GReD is a Research Center at Clermont-Ferrand, Auvergne Rhône Alpes region of France. Created in 2008, the GReD is supported by the University Clermont Auvergne (UCA), the CNRS (UMR6293) and the INSERM (U1103). The center is composed of 14 research groups (totalling 147 people in December 2017) based at the Centre de Recherche Bio-Clinique (CRBC) on the campus ...
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